Dalam pembangunan Zona Integritas Menuju Wilayah Bebas dari Korupsi dan Wilayah Birokrasi Bersih Melayani, fokus pelaksanaan reformasi birokrasi di RSUD Tugu Koja tertuju pada dua sasaran utama, yaitu :
- Terwujudnya Pemerintahan yang Bersih dan Bebas KKN
- Terwujudnya Peningkatan Kualitas Pelayanan Publik kepada Masyarakat
Guna memenuhi amanat tersebut, RSUD Tugu Koja berupaya melaksanakan :
- Komitmen pencegahan korupsi melalui pelaksanaan kegiatan anti korupsi yang nyata secara terpadu dan disesuaikan dengan kebutuhan unit
- Meningkatkan kualitas pelayanan publik kepada masyarakat
- Melaksanakan pembangunan zona integritas menuju wilayah bebas dari korupsi yang meliputi manajemen perubahan, penataan tata laksana, penataan system manajemen sumber daya manusia, penguatan akuntabilitas kinerja, penguatan pengawasan, dan penguatan kualitas pelayanan publik.